距机场恐怖袭击爆炸案已经过去半年，警视厅公安部特务第一课警部仓木尚武（西岛秀俊 饰）撇开本职工作，全力追查妻子之死的真相，奔走辛劳过后让他瞥见俄罗斯恐怖组织Grzib的影子，在追查神秘之人伊万·泰勒时与自由撰稿人名波汐里（苍井优 饰）形成交集。与此同时，接二连三的冰锥杀人案发生，令仓木和搜查一课警部补大杉良太（香川照之 饰）想起本该葬身大海的新谷和彦（池松壮亮 饰）。另一方面，明星美希（真木阳子 饰）从未放弃寻找父亲的努力，直到某天父亲的身姿终于出现在视野中，但却给了她前所未有的冲击。千寻之死和α作战背后的秘密渐渐浮现，纷乱的线索逐一汇集一处，令人难以置信的真相以及攸关国家的更大的黑暗与阴谋则迟迟不曾显露……
